2006年4月，北碚区政府清理配套费时发现，畔溪名都三期工程配套费不属于减免范围，要求补缴。杨军与相关部门人员一起进行追缴。当年6月，加上一、二期的一些费用，远海公司补缴了179万余元的工程配套费。
开发商逃跑事发
2007年2月，李志与其他股东发生纠纷，卷款逃跑。远海公司其他股东遂报案，并向北碚区政府通报了李志记录的账目中有人占干股，购买免费房、优惠房等，北碚区政府责成北碚区建委负责调查。
此时，杨军感到不安，但不知自己买房一事是否构成犯罪，遂主动向北碚区监察局领导汇报了此事。在杨军的强烈要求下，其妻谢某以38万元的价格卖掉了那套房屋，多余的16万余元房款全部上缴到北碚区纪委廉政账户。之后，杨军又向区纪委说明了这一情况。
去年9月17日，一条关于杨军涉嫌受贿的线索传到江北区检察院，第二天，杨军在办公室里被检察官带走，第三天，杨军被刑拘。
一审被判4年
今年7月，江北区法院对此案进行了审理。
杨军的辩护律师、合纵律师事务所肖勇和李忠泽为他进行了无罪辩护。辩护人称，当时，杨军没有审批决定权，不可能为李志作出配套费减半的承诺。因为配套费征收是由北碚区建委负责，建筑管理站仅是建委下属事业单位，任副站长的杨军，只负责对配套费缴纳情况进行核查，无权审批决定。减半费用实际是区建委开会决定的，杨军只是依会议纪要执行，所以，他没有利用职务之便。
杨军与李志达成买房协议是2003年底，当时，畔溪名都二期并未开盘，房价未涨，该楼盘销售情况不佳，以比开盘价低的价格预订，很正常，是民事行为。2004年4月，该楼盘二期开盘定价为2572元/平方米。据统计局数据显示，当时，北碚区住宅类商品房均价仅为1200余元/平方米，说明开发商定价偏高，不能说杨军获得了好处。
法院认为，统计局的统计是平均价格，不能等同于涉案房屋的市场价格。经评估，该房屋价值51万余元，法院认定，杨军利用经办配套费核查工作之便，在减半征收开发商配套费后，以明显低于市场价购买了该房屋，构成受贿罪，金额达30万余元。因有自首情节、认罪态度好，今年8月，一审法院判决杨军有期徒刑4年。
二审改判为3年
杨军不服，提起上诉。
10月中旬，市一中院对此案进行了二审。除了一审的观点，杨军的辩护律师提出，即使其行为构成受贿罪，一审法院在受贿金额上的认定有误。辩护方举示了北碚区法院在审理李志行贿案中，北碚区价格认证中心对李志行贿杨军的涉案房屋评估价值为45万余元，并将此金额作为李志行贿杨军金额的定案依据。杨军的辩护律师认为，根据“疑义有利于被告人原则”，法院不应根据高出5万余元的价值来作为评判依据。
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